L'entreprise acquiert son indépendance de Acer le 5 décembre 2001 en étant dotée des divisions communications et multimédia de sa maison mère qui se recentrait sur la production et la distribution d'ordinateurs et de moniteurs. BenQ est depuis spécialisé dans la conception, production et la vente de produits électroniques destinés au grand public tels que : les périphériques informatique (claviers, souris, moniteurs, vidéo projecteurs…), les appareils mobiles (baladeurs, lecteurs MP3 Joy Bee, appareils photo numériques, téléphones) et les ordinateurs portables et media centers .

Le 1 ^er octobre 2005 , BenQ acquiert la majeure participation de la branche communication mobile de Siemens , et la rebaptise BenQ-Siemens. En 2006 , BenQ annonce la faillite de cette division, à la suite de cela et sans avoir trouvé de repreneur, BenQ cesse la production de ses téléphones mobiles de presque 70 %, sauf en Asie où la marque reste un des leaders dans le secteur des télécommunications mobiles.

Les usines de BenQ sont basées à Taïwan et en Chine , son chiffre d'affaires en 2004 s'établit à 5,7 milliards de dollars et 10 100 personnes étaient employées. Le fonctionnement d'un groupe tel que BenQ est particulier : les filiales sont autonomes et cotées en bourse, les liens capitalistiques sont très nombreux entre ces entreprises et d'autres acteurs majeurs à Taïwan. Depuis peu, les filiales et les participations du groupe BenQ sont réunies sous la holding Qisda dont le groupe BenQ est une filiale à 100 %